MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 52982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009051	G	6	6	160790	160795	0 %	0 %	100 %	0 %	126178127
3502	NC_009051	GTC	2	6	160870	160875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178128
3503	NC_009051	AGG	2	6	160880	160885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178128
3504	NC_009051	CGA	2	6	160929	160934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178128
3505	NC_009051	TCGC	2	8	160957	160964	0 %	25 %	25 %	50 %	126178128
3506	NC_009051	ATC	2	6	160970	160975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178128
3507	NC_009051	AGC	2	6	160982	160987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178128
3508	NC_009051	CT	3	6	160997	161002	0 %	50 %	0 %	50 %	126178128
3509	NC_009051	CCT	2	6	161007	161012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178128
3510	NC_009051	TTC	2	6	161645	161650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178129
3511	NC_009051	CAG	2	6	161693	161698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178129
3512	NC_009051	ATT	2	6	162049	162054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126178130
3513	NC_009051	GCG	2	6	162150	162155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178130
3514	NC_009051	CGG	3	9	162241	162249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178131
3515	NC_009051	CAT	2	6	162284	162289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178131
3516	NC_009051	GATC	2	8	162314	162321	25 %	25 %	25 %	25 %	126178131
3517	NC_009051	GAT	2	6	162363	162368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178131
3518	NC_009051	GGAC	2	8	162393	162400	25 %	0 %	50 %	25 %	126178131
3519	NC_009051	ATCT	2	8	162411	162418	25 %	50 %	0 %	25 %	126178131
3520	NC_009051	TCAC	2	8	162448	162455	25 %	25 %	0 %	50 %	126178131
3521	NC_009051	TGA	2	6	162457	162462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178131
3522	NC_009051	CCGGC	2	10	162595	162604	0 %	0 %	40 %	60 %	126178132
3523	NC_009051	C	6	6	162659	162664	0 %	0 %	0 %	100 %	126178132
3524	NC_009051	AGG	2	6	162679	162684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178132
3525	NC_009051	ACG	2	6	162712	162717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178132
3526	NC_009051	CTT	2	6	163227	163232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178133
3527	NC_009051	ATC	2	6	163302	163307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178133
3528	NC_009051	T	6	6	163334	163339	0 %	100 %	0 %	0 %	126178133
3529	NC_009051	CCAA	2	8	163347	163354	50 %	0 %	0 %	50 %	126178133
3530	NC_009051	AGG	2	6	163375	163380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178133
3531	NC_009051	TCC	2	6	163503	163508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178133
3532	NC_009051	CA	3	6	163545	163550	50 %	0 %	0 %	50 %	126178133
3533	NC_009051	TTGC	2	8	163647	163654	0 %	50 %	25 %	25 %	126178133
3534	NC_009051	CAG	2	6	163756	163761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178133
3535	NC_009051	TTC	2	6	163787	163792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178133
3536	NC_009051	AGA	2	6	163798	163803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178133
3537	NC_009051	GCG	2	6	163821	163826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178133
3538	NC_009051	AAT	2	6	163831	163836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126178133
3539	NC_009051	TGA	2	6	163842	163847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178133
3540	NC_009051	CGG	2	6	163862	163867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178133
3541	NC_009051	CAT	2	6	163898	163903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178133
3542	NC_009051	CAA	2	6	164008	164013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178133
3543	NC_009051	GAC	2	6	164123	164128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178133
3544	NC_009051	TGGA	2	8	164160	164167	25 %	25 %	50 %	0 %	126178133
3545	NC_009051	TC	3	6	164272	164277	0 %	50 %	0 %	50 %	126178133
3546	NC_009051	CAT	2	6	164437	164442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178133
3547	NC_009051	CGT	2	6	164478	164483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178133
3548	NC_009051	ATC	2	6	164519	164524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178133
3549	NC_009051	TCC	2	6	164560	164565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178133
3550	NC_009051	GCG	2	6	164630	164635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178133
3551	NC_009051	TTA	2	6	164679	164684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126178133
3552	NC_009051	CTT	2	6	164692	164697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178133
3553	NC_009051	TCA	2	6	164727	164732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178133
3554	NC_009051	TC	3	6	164799	164804	0 %	50 %	0 %	50 %	126178133
3555	NC_009051	C	7	7	164885	164891	0 %	0 %	0 %	100 %	126178133
3556	NC_009051	TTTC	2	8	164959	164966	0 %	75 %	0 %	25 %	126178133
3557	NC_009051	TGA	2	6	165181	165186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178134
3558	NC_009051	AT	3	6	165209	165214	50 %	50 %	0 %	0 %	126178134
3559	NC_009051	CCT	2	6	165294	165299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178134
3560	NC_009051	AGG	2	6	165358	165363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178134
3561	NC_009051	CGGCC	2	10	165506	165515	0 %	0 %	40 %	60 %	126178134
3562	NC_009051	CGG	2	6	165582	165587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178134
3563	NC_009051	CTC	2	6	165633	165638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178134
3564	NC_009051	TCC	2	6	165639	165644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178134
3565	NC_009051	CGT	2	6	165653	165658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178134
3566	NC_009051	GGC	2	6	165701	165706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178134
3567	NC_009051	GCG	2	6	165713	165718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178134
3568	NC_009051	TCG	2	6	165730	165735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178134
3569	NC_009051	ACT	2	6	165760	165765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178134
3570	NC_009051	GCG	2	6	165782	165787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178134
3571	NC_009051	G	6	6	165787	165792	0 %	0 %	100 %	0 %	126178134
3572	NC_009051	GCC	2	6	165819	165824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178134
3573	NC_009051	ATC	2	6	165835	165840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178134
3574	NC_009051	CCGGTC	2	12	165897	165908	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126178134
3575	NC_009051	CG	3	6	165929	165934	0 %	0 %	50 %	50 %	126178134
3576	NC_009051	C	6	6	165947	165952	0 %	0 %	0 %	100 %	126178134
3577	NC_009051	GGC	2	6	165953	165958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178134
3578	NC_009051	GGA	2	6	165959	165964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178134
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3580	NC_009051	TCC	3	9	166015	166023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178134
3581	NC_009051	GGA	2	6	166043	166048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178134
3582	NC_009051	GTC	2	6	166071	166076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178134
3583	NC_009051	CGGC	2	8	166092	166099	0 %	0 %	50 %	50 %	126178134
3584	NC_009051	CG	4	8	166112	166119	0 %	0 %	50 %	50 %	126178134
3585	NC_009051	GTC	2	6	166176	166181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178134
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3588	NC_009051	GAC	2	6	166280	166285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178134
3589	NC_009051	CGG	2	6	166303	166308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178134
3590	NC_009051	CGG	2	6	166354	166359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178134
3591	NC_009051	GGGGA	2	10	166368	166377	20 %	0 %	80 %	0 %	126178134
3592	NC_009051	G	6	6	166396	166401	0 %	0 %	100 %	0 %	126178134
3593	NC_009051	GAG	2	6	166449	166454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178134
3594	NC_009051	TGA	2	6	166530	166535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178134
3595	NC_009051	CGG	2	6	166570	166575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178135
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3601	NC_009051	TGA	2	6	166756	166761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178135
3602	NC_009051	CTT	2	6	166768	166773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178135
3603	NC_009051	TGC	2	6	166801	166806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178135
3604	NC_009051	TAC	2	6	167018	167023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178135
3605	NC_009051	GA	3	6	167026	167031	50 %	0 %	50 %	0 %	126178135
3606	NC_009051	AGA	2	6	167086	167091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178135
3607	NC_009051	A	6	6	167124	167129	100 %	0 %	0 %	0 %	126178135
3608	NC_009051	AG	3	6	167170	167175	50 %	0 %	50 %	0 %	126178135
3609	NC_009051	GTTG	2	8	167176	167183	0 %	50 %	50 %	0 %	126178135
3610	NC_009051	CGG	2	6	167188	167193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178135
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3612	NC_009051	CGA	2	6	167284	167289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178135
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3616	NC_009051	A	6	6	167971	167976	100 %	0 %	0 %	0 %	126178136
3617	NC_009051	GAT	2	6	168006	168011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178136
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3622	NC_009051	CCG	2	6	168109	168114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178136
3623	NC_009051	TTC	2	6	168157	168162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178136
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3626	NC_009051	CGT	2	6	168525	168530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178137
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3652	NC_009051	GTG	2	6	169749	169754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178138
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3988	NC_009051	GCG	2	6	188386	188391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178156
3989	NC_009051	GAA	2	6	188430	188435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178156
3990	NC_009051	GAC	2	6	188448	188453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178156
3991	NC_009051	CGG	2	6	188483	188488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178156
3992	NC_009051	GAC	2	6	188598	188603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178156
3993	NC_009051	CGA	2	6	188642	188647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178156
3994	NC_009051	GAG	2	6	188679	188684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178156
3995	NC_009051	CGG	2	6	188735	188740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178156
3996	NC_009051	GCCC	2	8	189289	189296	0 %	0 %	25 %	75 %	126178157
3997	NC_009051	TCA	3	9	189347	189355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178157
3998	NC_009051	CTTC	2	8	189393	189400	0 %	50 %	0 %	50 %	126178157
3999	NC_009051	TC	4	8	189402	189409	0 %	50 %	0 %	50 %	126178157
4000	NC_009051	TTGT	2	8	189430	189437	0 %	75 %	25 %	0 %	126178157

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